116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0775 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  100 
 
 		 128 aa  228  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  32.14 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  30.97 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  30.93 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  38.14 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  38.14 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  38.14 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  42.03 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  40 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  37.66 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  50 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  36.46 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  32.63 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  32.63 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  37.23 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  42.65 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  48.65 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  31.87 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  37.5 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  38.46 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  32 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  31.19 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  44.87 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  32.18 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  30.11 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  40.79 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  44.57 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  29.2 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  29.03 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  41.25 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  41.25 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  29.89 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  29.89 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  38.67 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  40.54 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  33.94 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  37.37 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  44 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  40.51 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  40.51 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  40.51 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  40.28 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  40.28 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  33.75 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  25 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  50.79 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  39.19 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  32 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3510  murein hydrolase exporter  41.38 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  40 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  41.51 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3498  murein hydrolase exporter  41.38 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000157702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  39.19 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  35.94 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  35.94 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  35.94 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  30.17 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  30.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  30.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  30.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  30.17 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  37.97 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  26.44 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  30.17 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  30.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  30.17 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  30.17 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  35.48 
 
 		 136 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  43.66 
 
 		 123 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  37.8 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>