100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0184 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  296  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0905  LrgA family protein  52.14 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  38.85 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  44.92 
 
 
143 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  41.27 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  41.27 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  41.27 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  41.27 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  41.27 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  41.27 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  40.48 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  40.48 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  42.37 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  33.08 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  33.08 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  40.86 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  32.2 
 
 
132 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  30.51 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  30.51 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  30.51 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  30.51 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  30.51 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  30.51 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  29.66 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  28.57 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  28.16 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  32.69 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  29.09 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  29.29 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  28.97 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  26.36 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  26.36 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  28.3 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.23 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  36.73 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  27.91 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  30.23 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  30.23 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30.23 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  31.65 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  29.07 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  28.57 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  29.29 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  31.53 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  26.17 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  28.24 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  26.8 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  33.68 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  26.21 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  27.37 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  20 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  29.2 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  23.53 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  32.73 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  30.77 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  30.77 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  30.85 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  31.43 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  31.43 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  31.43 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  28 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  27.84 
 
 
119 aa  43.9  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  28.21 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  27.4 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  26.55 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  30.61 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  27.85 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  31.37 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  23.81 
 
 
248 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  27.55 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  25.96 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  36.08 
 
 
121 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  30.77 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  21.95 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  23.33 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  23.33 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  23.33 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  26.67 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  26.53 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  30.28 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  27.36 
 
 
128 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  30.43 
 
 
123 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  26.03 
 
 
121 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>