79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3645 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  100 
 
 		 128 aa  240  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  98.44 
 
 		 128 aa  235  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  96.09 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  57.02 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  58.27 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  61.42 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  53.54 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  56 
 
 		 127 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  53.08 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  54.4 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  47.97 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  50.39 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  36.29 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  42.19 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  45.31 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  39.06 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  42.28 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  42.11 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  39.06 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  40.16 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  37.5 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  37.4 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  35.94 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  35.59 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  36.84 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  41.94 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  35.34 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  34.09 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  38.52 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  43.48 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  34.85 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  35.94 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  36.84 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  40.62 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  45.53 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  51.67 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  36.07 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  31.78 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  31.58 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  42.24 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  42.24 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  29.82 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  30.77 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  41.38 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  30.65 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  41.38 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  40.35 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  39.06 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  40.62 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  32.11 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  29.6 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  26.36 
 
 		 248 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  39.81 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  32.98 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  39.34 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  41.38 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  35.77 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  40.62 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4059  LrgA family protein  39.77 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  31.52 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  29.89 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  27.34 
 
 		 130 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  29.35 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  25.64 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  26.77 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  30.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  35.23 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  30.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>