72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3929 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  100 
 
 		 128 aa  238  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  96.09 
 
 		 128 aa  230  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  96.09 
 
 		 128 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  57.02 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  57.48 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  60.18 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  52.76 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  53.77 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  55.2 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  53.08 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  50.39 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  46.34 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  40.62 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  46.22 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  43.41 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  36.72 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  34.68 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  41.23 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  35.94 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  35.94 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  38.28 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  44.35 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  40.16 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  36.84 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  36.64 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  35.59 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  37.7 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  33.83 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  32.58 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  44.35 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  34.09 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  40.62 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  35.94 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  45.53 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  51.67 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  35.96 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  42.24 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  42.24 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  36.07 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  41.38 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  41.38 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  39.06 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  29.91 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  40.62 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  30.4 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  29.84 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  29.82 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  29.82 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.7 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  28.95 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  29.82 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  37.4 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  39.81 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  39.47 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  29.06 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  42.53 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  38.52 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  28.3 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  31.91 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  40.62 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4059  LrgA family protein  41.38 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  35.77 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  38.37 
 
 		 117 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  25.78 
 
 		 153 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  25.64 
 
 		 126 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  29.09 
 
 		 124 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>