115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0545 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  100 
 
 		 127 aa  236  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  71.65 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  69.7 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  66.94 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  56 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  55.2 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  62.6 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  54.4 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  50.42 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  52.07 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  45.45 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  47.17 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  42.86 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  43.64 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  47.62 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  38.33 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  44.55 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  41.51 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  40.16 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  38.18 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  42.15 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  35.71 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  45.45 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  38.32 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  33.6 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  38.39 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  35.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  32.26 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  37.84 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  34.96 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  40.87 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  36.61 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  38.64 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  38.64 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  32.5 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  27.83 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  32.41 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  45.31 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  33.64 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  31.48 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  39.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  41.41 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  35.45 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  28.33 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.56 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  27.55 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  39.25 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  28.1 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  28 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  36.75 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  34.19 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  40.57 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  35.04 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  30.09 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  36.36 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  30.09 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  30.09 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  28.18 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  30.3 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  35.14 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  26.04 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  35.06 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  27.36 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  35.06 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  25.49 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  36.21 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  34.55 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  34.55 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  28.7 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  36.9 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  36.9 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  34.96 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  36.47 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5233  murein hydrolase regulator LrgA  35.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  36.36 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  32.04 
 
 		 138 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  39.02 
 
 		 117 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  36.9 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  36.9 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  34.69 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  25.44 
 
 		 124 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  32.04 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  32.65 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  32.04 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  32.04 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  32.04 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>