108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1099 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  63.36 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  72.66 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  67.44 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  55.2 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  54.4 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  64.29 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  55.2 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  53.03 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  52.85 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  48.18 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  48.62 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  43.86 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  49.12 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  47.37 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  43.86 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  35.88 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  45.61 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  39.82 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  35.88 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  37.12 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  39.39 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  36.8 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  38.89 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  34.38 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  36.36 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  37.12 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  34.62 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  43.7 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  40.54 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  40.16 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  34.21 
 
 		 117 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  35.96 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  40.77 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  36.36 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  32.77 
 
 		 248 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  38.35 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  32.8 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  36.36 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  30.09 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  42.19 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  31.68 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  39.45 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  37.88 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  45.54 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1230  LrgA family protein  24.8 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  37.82 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  36.67 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  29.27 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  36.84 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  30 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  35.96 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  35.96 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  32.35 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  32.35 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  38.89 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  28.44 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  42.68 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  37.8 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  34.78 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  26 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  27.78 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  39.53 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  26.85 
 
 		 125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0184  hypothetical protein  27.45 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  31.46 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  30.39 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  30.77 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  40.77 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  33.64 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  33.64 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  28.7 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  33.64 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  33.64 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5620  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  29.41 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>