92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1953 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  42.02 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  36.67 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  41.67 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  36.89 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  36.97 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  38.14 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  32.84 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  38.21 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  38.21 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  36.97 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  35.66 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  37.5 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  32.2 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  36.59 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  36.67 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  31.93 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  41.18 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  41.38 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  37.82 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  33.64 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  40.2 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  36.13 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  37.9 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  27.82 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  36.45 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  37.4 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  39.29 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  35.09 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  30.34 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  25.66 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  38.35 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  34.19 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  35.09 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  35.51 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  38.66 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  29.41 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  36.13 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  30.71 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  41.18 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  37.82 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  37.5 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  37.5 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  35.4 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  29.57 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  36.61 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  30.51 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  29.36 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  25.32 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  36.61 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  33.61 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  41.05 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  26.96 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.84 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  30.84 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  37.69 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  33.61 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  41.03 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  38.14 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  28.81 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  28.81 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  28.81 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  40 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  27.82 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  32.67 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  29.91 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  37.33 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  29.13 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  37.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  29.57 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  25.76 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  28.95 
 
 		 121 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  28.95 
 
 		 121 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>