54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1160 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  100 
 
 		 116 aa  218  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  37.39 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  40.18 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  35.4 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  37.84 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  34.55 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  37.39 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  35.04 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  36.52 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  40.37 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  44.9 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  43.8 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  40.95 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  34.55 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  36.13 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  45 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  38.53 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  36.84 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  32.2 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  35.77 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  35.77 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11920  hypothetical protein  42.22 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00345177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  38.68 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  31.3 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  34.55 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  37.37 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  36.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  36.21 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  34.82 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  28.7 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  33.94 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  34.02 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  32.35 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  29.36 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08300  integral membrane protein, LrgA family  39.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  32.35 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  42.34 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  34.23 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  37.72 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  38.68 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  37.72 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3809  LrgA family protein  34.19 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  32.2 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  33.03 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  39.25 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  37.74 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  37.74 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  37.74 
 
 		 123 aa  43.5  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4981  LrgA  41.07 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  37.07 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  25.64 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  38.95 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  30.25 
 
 		 124 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  33.65 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>