144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3734 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  100 
 
 
169 aa  321  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  52.54 
 
 
119 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  51.79 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  50.45 
 
 
116 aa  98.2  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  49.58 
 
 
121 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  49.11 
 
 
130 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  47.06 
 
 
122 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  46.67 
 
 
122 aa  91.7  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  50.89 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  49.55 
 
 
113 aa  84.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  50.91 
 
 
124 aa  84  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  44.25 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  44.26 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  41.82 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  47.97 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  45.54 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  49 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  47.58 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  43.7 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  41.74 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  50.83 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  48.78 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  48.21 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  28.85 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  34.23 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  37.61 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  34.23 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  42.98 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  50.96 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  48.11 
 
 
126 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  51.92 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  44.55 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  50.96 
 
 
123 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  50.96 
 
 
123 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  52.48 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  45.9 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  43.56 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  31.19 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  50 
 
 
123 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  29.82 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  28.57 
 
 
115 aa  62.4  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  30.77 
 
 
134 aa  61.6  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  31.82 
 
 
121 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  31.82 
 
 
121 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  30 
 
 
121 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.91 
 
 
121 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  39.84 
 
 
128 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  41.03 
 
 
117 aa  61.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  39.84 
 
 
128 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  37.07 
 
 
116 aa  60.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  30.91 
 
 
121 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  30 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  30.91 
 
 
121 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  30.91 
 
 
121 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  30 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  30.91 
 
 
121 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  37.72 
 
 
120 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  37.82 
 
 
120 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  43.59 
 
 
117 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  37.23 
 
 
119 aa  57.8  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  44.44 
 
 
121 aa  57.8  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  27.78 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  35.29 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  41.23 
 
 
128 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3294  LrgA  42.25 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  32.14 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  30.34 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  45 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  48.86 
 
 
123 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  50.5 
 
 
127 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  23.13 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3809  LrgA family protein  41.53 
 
 
119 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  31.4 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  41.58 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  30.58 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  30.58 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  31.4 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  30.58 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  31.37 
 
 
132 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  23.93 
 
 
143 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  29.9 
 
 
118 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5535  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  31.4 
 
 
114 aa  50.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5294  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5121  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5136  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5690  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5564  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5385  murein hydrolase regulator LrgA  23.2 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.655957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  39.17 
 
 
125 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>