135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0155 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  100 
 
 		 118 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  49.09 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  45.76 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  45.22 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  51.92 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  46.15 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  46.83 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  46.83 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  42.15 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  48.39 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  47.54 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  42.74 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  50 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2739  LrgA family protein  55.75 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  45.6 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  45.45 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  40.34 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  38.74 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  51.92 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  51.92 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  51.92 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  50.96 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  44.44 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  50 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  50 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  40.91 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  51.92 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  42.45 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  38 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  41.73 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  42.34 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  35.9 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  48.15 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  42.16 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  42.31 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  53.98 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  38.46 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4059  LrgA family protein  53.1 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  45.45 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  52.08 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  42.62 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  39.66 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  38.52 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  46.67 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  37.96 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  33.93 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  41.54 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  44.63 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  34.62 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  46.02 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  31.67 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  43.8 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  30.83 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  33.72 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  38.18 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  40.77 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  34.88 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  36.97 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  31.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  31.48 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  34.52 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  34.52 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  34.52 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  48.15 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  31 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  36.44 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  37.35 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  37.35 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  37.35 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  37.35 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  37.35 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  32.56 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  35.44 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  42.42 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  33.66 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  35.71 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  38.96 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>