132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2908 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2908  LrgA family protein  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  57.25 
 
 		 248 aa  155  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  34.82 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  37.17 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  38.95 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  36.28 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  37.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  37.61 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  31.67 
 
 		 138 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  32.5 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  31.67 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0247  murein hydrolase regulator LrgA  25.75 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  25.75 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  37.11 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  37.11 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  37.11 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1950  LrgA family protein  31.3 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000107186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  32.29 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  31.09 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  32.52 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  32.5 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  33.93 
 
 		 128 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  34.65 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  34.78 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  34.62 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  36.79 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  30.89 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  31.09 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  31.09 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  36.45 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  33.64 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  31.09 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  31.09 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  31.09 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  31.09 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  30.89 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  30.89 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  35 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  29.41 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  30.25 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  38.32 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2764  LrgA family protein  33.96 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1346  LrgA family protein  46.34 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.749748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  28.07 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  34.69 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  34.91 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  31.19 
 
 		 119 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  35.14 
 
 		 131 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  35.14 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  33.33 
 
 		 123 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  24.74 
 
 		 117 aa  51.2  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  25.45 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2026  murein hydrolase regulator LrgA  29.55 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  35.82 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  39.73 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  24.58 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  31.53 
 
 		 130 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  27.19 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  31.25 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  34.45 
 
 		 129 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  29.81 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  36.99 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  29.81 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  32.41 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  29.81 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  29.41 
 
 		 115 aa  48.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  37.25 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  38.36 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  31.86 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  38.36 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  38.36 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  36.99 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1681  inner membrane protein, LrgA family  34.72 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  32.77 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  34.51 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  29.92 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0073  LrgA family protein  30 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  32.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  25 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  32.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5572  murein hydrolase regulator LrgA  21.43 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3957  murein hydrolase regulator LrgA  25.47 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  32.5 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  37.18 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>