35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0447 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0447  LrgA  100 
 
 		 121 aa  228  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0374  LrgA  53.12 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  34.4 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  44.14 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  37.07 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  36.75 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  29.27 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  31.25 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  34.65 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  35 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  31.36 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  34.82 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  33.02 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1095  hypothetical protein  34.17 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  28.8 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  32.52 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  32 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  34.95 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  35.34 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  39.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  39.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  39.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  37.5 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0735  LrgA family protein  35.59 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  30.08 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  31.03 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0636  LrgA  37.04 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  37.8 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11920  hypothetical protein  34.17 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00345177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  31.97 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2210  LrgA family protein  30.89 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522821  normal  0.122076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08300  integral membrane protein, LrgA family  33.61 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0814832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2404  LrgA family protein  30.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2976  LrgA family protein  30.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.952939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>