More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2287 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  51.56 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  51.18 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  53.91 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0591  MgtC/SapB transporter  51.39 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3306  MgtC/SapB transporter  50.38 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  42.97 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  42.97 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  42.19 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  37.14 
 
 		 238 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0259  hypothetical protein  43.07 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.448528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  35.92 
 
 		 238 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  40.62 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  36 
 
 		 245 aa  85.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  40.91 
 
 		 189 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  34.55 
 
 		 238 aa  84.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  44.34 
 
 		 194 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  39.69 
 
 		 172 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  37.14 
 
 		 240 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  41.54 
 
 		 189 aa  84  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  37.86 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  35.76 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6348  MgtC/SapB transporter  43.87 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  48.91 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  40.98 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  37.01 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  34.93 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  42.02 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  39.68 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  41.41 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  35.21 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  48.89 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  44.34 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  38.18 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  40.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  35.88 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  37.76 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  37.31 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  35.25 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  36.3 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  41.44 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  34.85 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  38.4 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  33.56 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  36.3 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  42.34 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  42.06 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  33.57 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  33.57 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  33.57 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  38.66 
 
 		 238 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  35.33 
 
 		 240 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  44.44 
 
 		 234 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  38.21 
 
 		 238 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  39.64 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  39.81 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  38.28 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  34.67 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  34.97 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  33.53 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  34.97 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  37.07 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  45 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  40.5 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  39.05 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  40.14 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  28.67 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  37.74 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  36.51 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  37.82 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  38.98 
 
 		 227 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  31.58 
 
 		 218 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  46.67 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  38.1 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  39.81 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  34.62 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  37.1 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  40.2 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  36.36 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  35.86 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  34.48 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_7258  putative MgtC family protein  40.98 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  40.2 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  36.72 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  40.2 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  38.74 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  40.2 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  37.8 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  39.22 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  40.78 
 
 		 237 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  40.2 
 
 		 235 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
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NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  37.7 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  39.22 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
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NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  36.13 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  40.2 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
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NC_011899  Hore_07790  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  41.9 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
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