293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1155 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  44.87 
 
 
240 aa  198  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  44.02 
 
 
240 aa  194  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  39.55 
 
 
216 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  40.97 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  45.52 
 
 
168 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  37.78 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  34.62 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  34.72 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  35.75 
 
 
235 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  36.53 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  34.39 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  39.01 
 
 
227 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  43.24 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  33.78 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  42.07 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  37.79 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  30 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  39.29 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  41.96 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  34.21 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  35.2 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  39.72 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  37.16 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  38.27 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  38.78 
 
 
225 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  40.28 
 
 
133 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  36.61 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  38.27 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  44.29 
 
 
174 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  33.16 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  38.27 
 
 
225 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  40.28 
 
 
133 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  41.61 
 
 
162 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  39.04 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  39.04 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  39.04 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  40.28 
 
 
133 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  40.14 
 
 
163 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  40.27 
 
 
162 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  38.27 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  35.81 
 
 
170 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  35.48 
 
 
165 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  36.73 
 
 
225 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  33.7 
 
 
226 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  33.15 
 
 
226 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  40 
 
 
231 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  37.08 
 
 
227 aa  104  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  36.53 
 
 
231 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  32.71 
 
 
239 aa  104  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  39.07 
 
 
219 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  41.45 
 
 
243 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  39.07 
 
 
219 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.07 
 
 
219 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  40.14 
 
 
301 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  41.77 
 
 
226 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 
210 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  35.93 
 
 
305 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  41.86 
 
 
233 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  36.25 
 
 
219 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  37.68 
 
 
185 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  30.93 
 
 
229 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  42.47 
 
 
228 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  32.58 
 
 
242 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  41.13 
 
 
224 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  38.61 
 
 
231 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
225 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  37.66 
 
 
157 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  39.44 
 
 
172 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  39.44 
 
 
172 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  41.1 
 
 
228 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
172 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
184 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  32.98 
 
 
245 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  32.75 
 
 
250 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  36 
 
 
167 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  38.67 
 
 
243 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  37.97 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  40.69 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  38.67 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  38.67 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  38.67 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  37.97 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  38.67 
 
 
243 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  37.97 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  38.67 
 
 
243 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  34.54 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  27.55 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  30.98 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  37.76 
 
 
178 aa  99  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5039  sapB protein  27.55 
 
 
226 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000279435  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
232 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  27.04 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  30.98 
 
 
233 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  42.4 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  31.06 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5027  sapB protein  27.04 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0246703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  27.55 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 
287 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  36.75 
 
 
141 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>