More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0663 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  100 
 
 
161 aa  303  8.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  60.12 
 
 
165 aa  167  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  57.67 
 
 
165 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  55.71 
 
 
163 aa  147  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  52.74 
 
 
189 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  52.74 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  51.82 
 
 
161 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  47.18 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  50.34 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  53.97 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  53.1 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  57.85 
 
 
170 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  45.14 
 
 
162 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  47.33 
 
 
172 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  45.22 
 
 
172 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  45.22 
 
 
184 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  45.89 
 
 
151 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  44.59 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  57.02 
 
 
194 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  54.33 
 
 
205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  44.2 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  62.11 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3158  hypothetical protein  55.74 
 
 
163 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  45.27 
 
 
227 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  44.68 
 
 
182 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  41.25 
 
 
228 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  43.66 
 
 
227 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  42.47 
 
 
165 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  38.69 
 
 
226 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  44.2 
 
 
225 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  44.52 
 
 
185 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  40.48 
 
 
164 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  46.51 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  36.71 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  44.19 
 
 
215 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  37.91 
 
 
232 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  41.96 
 
 
233 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  42.36 
 
 
219 aa  97.1  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  42.36 
 
 
219 aa  97.1  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  42.36 
 
 
219 aa  97.1  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1768  MgtC/SapB transporter  44.14 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313608  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  48.03 
 
 
225 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  41.26 
 
 
233 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  40.71 
 
 
221 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  41.38 
 
 
232 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5985  Mg(II) transport ATPase  44.14 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  45.71 
 
 
238 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  40.82 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  42.45 
 
 
245 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 
231 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
150 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  44.88 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0789  MgtC/SapB transporter  44.29 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  41.61 
 
 
173 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  41.04 
 
 
225 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  40.44 
 
 
225 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  41.04 
 
 
225 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  41.04 
 
 
225 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  41.55 
 
 
245 aa  90.9  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  37.33 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  39.44 
 
 
215 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 
133 aa  90.5  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  36.24 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 
229 aa  90.5  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  39.44 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  39.44 
 
 
219 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.44 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  39.44 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  39.44 
 
 
219 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  39.44 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  42.62 
 
 
221 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  41.1 
 
 
237 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  41.3 
 
 
232 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  40.15 
 
 
238 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  41.43 
 
 
228 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2363  MgtC/SapB transporter  37.91 
 
 
150 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  39.44 
 
 
215 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  39.13 
 
 
225 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
225 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  46.67 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  38.41 
 
 
225 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
210 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  41.35 
 
 
237 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  33.1 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  41.35 
 
 
237 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  39.71 
 
 
225 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  40.98 
 
 
235 aa  87.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  39.42 
 
 
225 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  42.19 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  41.73 
 
 
133 aa  87  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  40.94 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  39.13 
 
 
232 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  39.13 
 
 
232 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  46.79 
 
 
166 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  38.13 
 
 
225 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  42.24 
 
 
212 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  36 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1860  MgtC/SapB transporter  50 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  47.22 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  38.13 
 
 
225 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>