More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5985 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5985  Mg(II) transport ATPase  100 
 
 		 152 aa  299  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1768  MgtC/SapB transporter  99.34 
 
 		 152 aa  297  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313608  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  61.59 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  57.75 
 
 		 189 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  57.04 
 
 		 189 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  55.63 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  56.03 
 
 		 162 aa  157  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  56.06 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  49.66 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  51.37 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  52.74 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  52.05 
 
 		 172 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  52.05 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  52.05 
 
 		 184 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  56.15 
 
 		 194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  54.11 
 
 		 170 aa  143  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  54.3 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  60 
 
 		 205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  55.91 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3158  hypothetical protein  56.3 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  56.3 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  51.38 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  47.69 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  46.4 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  46.4 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  46.4 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  45.69 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  37.25 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  38.57 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  35.77 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  36.31 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  45.16 
 
 		 225 aa  94.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  40.44 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  44.17 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  41.32 
 
 		 227 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  41.46 
 
 		 221 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  42.98 
 
 		 224 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  42.62 
 
 		 228 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1860  MgtC/SapB transporter  49.61 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  37.04 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  41.94 
 
 		 230 aa  91.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 		 215 aa  91.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  43.18 
 
 		 245 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  36.55 
 
 		 235 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  42.42 
 
 		 229 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  44.03 
 
 		 233 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  39.5 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  41.54 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  44.03 
 
 		 233 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  39.37 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  42.4 
 
 		 228 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  44.03 
 
 		 232 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6387  predicted protein  42.06 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0649963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  35.56 
 
 		 240 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  44.92 
 
 		 225 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  39.69 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  39.53 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  35.56 
 
 		 240 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  45.53 
 
 		 244 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.71 
 
 		 219 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  39.71 
 
 		 219 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  41.27 
 
 		 238 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  35.16 
 
 		 237 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  39.71 
 
 		 219 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  35.82 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  47.66 
 
 		 244 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  38.28 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  37.9 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  43.7 
 
 		 233 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  38.28 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  43.27 
 
 		 218 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  34.06 
 
 		 168 aa  83.6  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  39.84 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  44.8 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  41.35 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  33.97 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  37.84 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  40.91 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  45.31 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  40.77 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  39.68 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  38.06 
 
 		 238 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  37.8 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  37.23 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  40.91 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  43.75 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  39.85 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  40 
 
 		 221 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  34.38 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  39.13 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  42.4 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  40.8 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>