293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2114 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 178 aa  343  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  63.19 
 
 		 159 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  64 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  59.75 
 
 		 169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  47.06 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  45.95 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0789  MgtC/SapB transporter  47.89 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4053  MgtC/SapB transporter  47.59 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  46.72 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  43.08 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  40.57 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  41.13 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  42.06 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  46.09 
 
 		 227 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  45.9 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  40.62 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  40.62 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  43.97 
 
 		 245 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  35 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  45.9 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  47.06 
 
 		 231 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  39.01 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  38.93 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  39.07 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  39.68 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 		 233 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  44.25 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1376  MgtC/SapB transporter  47.22 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  46.43 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  44.14 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0446  MgtC/SapB transporter  35.03 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.631605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  40.77 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  41.43 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  41.54 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1271  MgtC/SapB transporter  38.1 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2398  MgtC/SapB transporter  40.98 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  40.5 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  41.41 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  37.97 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  40.34 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  36.15 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  39.68 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  34.72 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  39.37 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  46.15 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  40.77 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  45.69 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  42.52 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  38.58 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  38.14 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  38.14 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  38.14 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  34.53 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  38.58 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  34.07 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  40.87 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  31.65 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  32.76 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  34.67 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  32.87 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  40.35 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  44.09 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  46.32 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  38.3 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  35.51 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  37.11 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  41.96 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  38.79 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  37.11 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  32.56 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  36.11 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  37.78 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  37.11 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  35.51 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  36.05 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  38.13 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  36.43 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  31.65 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  33.33 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  33.78 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  38.62 
 
 		 244 aa  72  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  39.45 
 
 		 242 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4858  MgtC/SapB transporter  39.2 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  38.17 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  34.72 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  34.13 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  33.82 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  35.59 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  41.13 
 
 		 250 aa  70.9  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  35.77 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>