297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_733 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  100 
 
 		 133 aa  253  6e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  98.5 
 
 		 133 aa  249  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  95.49 
 
 		 133 aa  245  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  49.64 
 
 		 221 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  51.88 
 
 		 228 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  52.03 
 
 		 215 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  51.59 
 
 		 210 aa  117  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  56.9 
 
 		 228 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  56.03 
 
 		 228 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  53.54 
 
 		 219 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  53.08 
 
 		 231 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  53.08 
 
 		 243 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  55.56 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  55 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  55 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  52.99 
 
 		 221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  55.56 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  44.93 
 
 		 225 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  55 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  55.17 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  55.17 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  55.17 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  55.17 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  55.17 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  55.17 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  55.17 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  48.94 
 
 		 226 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  50.75 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  56.14 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  50.75 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  48.89 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  48.91 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  48.91 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  48.91 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  48.91 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  48.91 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  48.91 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  55.26 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  50.75 
 
 		 225 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  48.91 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  50.75 
 
 		 225 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 225 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 225 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  50.75 
 
 		 225 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  52.94 
 
 		 212 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  50.75 
 
 		 225 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  50.75 
 
 		 225 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  50.75 
 
 		 225 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  48.18 
 
 		 215 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  56.14 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 		 238 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  56.14 
 
 		 301 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  51.22 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  56.14 
 
 		 305 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  50.86 
 
 		 226 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  50 
 
 		 225 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  44.88 
 
 		 232 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  46.21 
 
 		 219 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  51.15 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  46.21 
 
 		 219 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  46.21 
 
 		 219 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  46.34 
 
 		 223 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  42.34 
 
 		 240 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  42.34 
 
 		 240 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  48.46 
 
 		 235 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  44.62 
 
 		 287 aa  103  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  45.11 
 
 		 237 aa  103  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  50.77 
 
 		 235 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  43.18 
 
 		 231 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  47.33 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  43.41 
 
 		 216 aa  102  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  42.75 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  53.15 
 
 		 242 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  46.92 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  44.44 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  49.57 
 
 		 240 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  48.03 
 
 		 227 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  44.44 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  44.44 
 
 		 184 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  49.58 
 
 		 174 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6387  predicted protein  43.55 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0649963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  49.58 
 
 		 225 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3506  MgtC/SapB transporter  49.17 
 
 		 226 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  45.97 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  38.57 
 
 		 248 aa  100  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  46.62 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 194 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  40.44 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1842  MgtC/SapB transporter  45.04 
 
 		 226 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000347447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  50 
 
 		 226 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4764  sapB protein  50 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0207  sapB protein  50 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000857338  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  50 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  50 
 
 		 226 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5006  sapB protein  50 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  50 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 227 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  41.67 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5039  sapB protein  50 
 
 		 226 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000279435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>