More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0991 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  64.38 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  62.66 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  63.91 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  60.13 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  61.69 
 
 		 172 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  61.69 
 
 		 184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  64 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  60.39 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  55.49 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  57.14 
 
 		 163 aa  174  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  56.52 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  54.55 
 
 		 174 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  51.48 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  55.41 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  64.39 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  58 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1768  MgtC/SapB transporter  55.56 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313608  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5985  Mg(II) transport ATPase  55.56 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  61.11 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3158  hypothetical protein  62.2 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  52.59 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  45.19 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  46.05 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  47.41 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  34.86 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  40.24 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  50.49 
 
 		 133 aa  98.2  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  37.41 
 
 		 150 aa  98.2  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  50.49 
 
 		 133 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  37.04 
 
 		 228 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  50.49 
 
 		 133 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  39.39 
 
 		 232 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  38.41 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  42.52 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  40.94 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.74 
 
 		 219 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  39.74 
 
 		 219 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  39.74 
 
 		 219 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  41.43 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  37.27 
 
 		 237 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  37.27 
 
 		 237 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  42.97 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  37.33 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  40.82 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  44.36 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  39.57 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  41.61 
 
 		 225 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  47.1 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  39.57 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  42.55 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.57 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  39.57 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  39.57 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  38.51 
 
 		 232 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  39.57 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  39.57 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  39.57 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  43.61 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  39.08 
 
 		 169 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  40.88 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 		 229 aa  91.3  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  36.65 
 
 		 237 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  41.72 
 
 		 164 aa  91.3  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  40.88 
 
 		 225 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  40.88 
 
 		 225 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  40.88 
 
 		 225 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  44.63 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  35.98 
 
 		 166 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  41.13 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  40.88 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  42.74 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  41.94 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  40.88 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  34.87 
 
 		 240 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  42.31 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  41.8 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  47.79 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  36.72 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  40.15 
 
 		 225 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  48.67 
 
 		 228 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  40.18 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  37.74 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 		 240 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  35.66 
 
 		 240 aa  88.6  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  46.92 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  36.57 
 
 		 141 aa  87.8  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  49.12 
 
 		 231 aa  87.8  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  48.31 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  47.37 
 
 		 231 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  40.15 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  47.79 
 
 		 228 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  41.54 
 
 		 234 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  44.27 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  47.37 
 
 		 231 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2363  MgtC/SapB transporter  43.66 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  48.31 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>