298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1929 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  100 
 
 
225 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  67.11 
 
 
225 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  60 
 
 
227 aa  262  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  54.91 
 
 
228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  52.68 
 
 
227 aa  224  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  54.23 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  45.77 
 
 
233 aa  187  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  39.37 
 
 
232 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  44.27 
 
 
221 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  37.69 
 
 
235 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  40.7 
 
 
231 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  44 
 
 
235 aa  131  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  35.27 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  35.27 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  35.27 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  39.07 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  44.52 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  34.56 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
239 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  36.92 
 
 
229 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  35.91 
 
 
210 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  46.62 
 
 
165 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07790  MgtC/SapB transporter  39 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1376  MgtC/SapB transporter  35.81 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  43.75 
 
 
150 aa  118  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  50.77 
 
 
232 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  35.47 
 
 
237 aa  118  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  50.77 
 
 
232 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  50.77 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  33.66 
 
 
225 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  33.66 
 
 
225 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  33.66 
 
 
225 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  33.66 
 
 
225 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  37.22 
 
 
233 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  50 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  33.66 
 
 
225 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  50.72 
 
 
226 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  34.36 
 
 
232 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  37.71 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  33.17 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  48.18 
 
 
226 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  34.65 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  47.45 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  34.21 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.67 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  44.83 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  33.5 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  48.18 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  44.53 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  32.97 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  33.15 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  35.83 
 
 
225 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  33.15 
 
 
219 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  38.92 
 
 
237 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  32.97 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  32.97 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  32.97 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  32.97 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  38.5 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  32.43 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  41.13 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  45.27 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  45.27 
 
 
234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  35.45 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2934  MgtC/SapB transporter  40.97 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  35.93 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  32.87 
 
 
244 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  40.56 
 
 
168 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5027  sapB protein  33.04 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0246703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  32.61 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  46.32 
 
 
227 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  48.2 
 
 
231 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  29.65 
 
 
225 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  47.01 
 
 
232 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  44.59 
 
 
237 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  33.04 
 
 
226 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  44.59 
 
 
237 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  48.2 
 
 
243 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0207  sapB protein  32.61 
 
 
226 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000857338  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  31.72 
 
 
223 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  33.04 
 
 
226 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  50.85 
 
 
231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  50.85 
 
 
231 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  37.16 
 
 
230 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5039  sapB protein  33.04 
 
 
226 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000279435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  50.85 
 
 
243 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  32.18 
 
 
225 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  50.85 
 
 
243 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  50.85 
 
 
231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  50.85 
 
 
243 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  41.22 
 
 
151 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  41.84 
 
 
240 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  41.26 
 
 
244 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 
225 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  51.69 
 
 
231 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  42.65 
 
 
185 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  50.83 
 
 
232 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  42.95 
 
 
244 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  50.85 
 
 
228 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>