295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0558 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  100 
 
 
240 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  97.08 
 
 
240 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  44.95 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  42.36 
 
 
216 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  41.59 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  35.44 
 
 
248 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  42.17 
 
 
231 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  47.26 
 
 
168 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  34.48 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  39.81 
 
 
238 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  32.74 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  33.63 
 
 
221 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  32.49 
 
 
244 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1271  MgtC/SapB transporter  36.1 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  32.76 
 
 
226 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  32.9 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  32.47 
 
 
226 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  45.52 
 
 
227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  35.22 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  40 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  32.29 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  41.78 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  31.58 
 
 
231 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  32.54 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  34.46 
 
 
219 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  46.72 
 
 
228 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  34.46 
 
 
219 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  37.95 
 
 
305 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  34.46 
 
 
219 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  39.52 
 
 
301 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  42.06 
 
 
227 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  40.91 
 
 
212 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  37.95 
 
 
231 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  34.44 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  36.76 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  36.76 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  36.76 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  36.76 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  32.11 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  36.76 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  36.76 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  31.58 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  33.33 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  35.56 
 
 
219 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  32.52 
 
 
239 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  43.45 
 
 
226 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  31.12 
 
 
229 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  25.57 
 
 
233 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  41.61 
 
 
133 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  40.74 
 
 
235 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  34 
 
 
225 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  35.68 
 
 
225 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  32.9 
 
 
232 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  28.07 
 
 
232 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  32.47 
 
 
232 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  42.22 
 
 
225 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  25.57 
 
 
233 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  34.67 
 
 
225 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  34 
 
 
225 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  34 
 
 
225 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  31.5 
 
 
225 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  34 
 
 
225 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  42.34 
 
 
133 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  42.34 
 
 
133 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  33.68 
 
 
242 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  46.4 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  36.6 
 
 
164 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  32.49 
 
 
225 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  46.4 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  46.4 
 
 
232 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  40.85 
 
 
165 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  33.5 
 
 
225 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  34 
 
 
225 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  35.14 
 
 
167 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  34.24 
 
 
225 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  38.82 
 
 
216 aa  101  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  42.4 
 
 
225 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  40.5 
 
 
245 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  31.09 
 
 
215 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07790  MgtC/SapB transporter  48.8 
 
 
221 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  31.09 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  31.09 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  31.09 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  30.85 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  31.09 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  31.09 
 
 
219 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  31.09 
 
 
219 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  29.26 
 
 
225 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  30.81 
 
 
210 aa  99.4  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  37.25 
 
 
189 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  30.85 
 
 
250 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
157 aa  98.6  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  37.59 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  30.05 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  32.62 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  27.16 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  31.64 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  36.6 
 
 
189 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  31.71 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  43.28 
 
 
174 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>