More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2296 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 174 aa  343  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  59.87 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  58.86 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  58.86 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  58.86 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  57.05 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  56.41 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  55.84 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  54.6 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  57.33 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  56.73 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  55.29 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  67.44 
 
 		 157 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  52.05 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  52.38 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  57.62 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  66.43 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3158  hypothetical protein  67.38 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  61.36 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1768  MgtC/SapB transporter  52.74 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313608  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5985  Mg(II) transport ATPase  52.74 
 
 		 152 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  47.1 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  43.21 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  50.43 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  49.58 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  44.19 
 
 		 232 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  49.58 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  48.74 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  43.18 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  48.41 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  47.2 
 
 		 228 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  44.03 
 
 		 240 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  41.48 
 
 		 226 aa  98.6  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  47.37 
 
 		 219 aa  98.2  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  46.81 
 
 		 240 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  47.37 
 
 		 219 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  47.37 
 
 		 219 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  45.39 
 
 		 240 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  46.77 
 
 		 221 aa  98.2  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  37.97 
 
 		 231 aa  97.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  39.19 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  40.97 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  42.64 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  46.81 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  43.61 
 
 		 229 aa  96.3  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  42.28 
 
 		 164 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  43.28 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  47.97 
 
 		 232 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  46.1 
 
 		 226 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 		 212 aa  94.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  41.61 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  45.99 
 
 		 238 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  37.87 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  43.31 
 
 		 150 aa  94  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  38.75 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  39.68 
 
 		 224 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  44.96 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  44.76 
 
 		 238 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  49.21 
 
 		 226 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  39.87 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  43.33 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  41.86 
 
 		 216 aa  92.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  43.94 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  45.16 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  45.16 
 
 		 232 aa  91.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  42.76 
 
 		 244 aa  91.7  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  43.85 
 
 		 221 aa  91.3  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  42.15 
 
 		 215 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  41.98 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  42.64 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  41.67 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  42.64 
 
 		 225 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  41.98 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  41.98 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  44.35 
 
 		 232 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  35.9 
 
 		 233 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  44.09 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.09 
 
 		 227 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  50.45 
 
 		 231 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  45.08 
 
 		 230 aa  88.2  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  40.77 
 
 		 225 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  41.22 
 
 		 225 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  41.86 
 
 		 225 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  40.94 
 
 		 215 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  39.19 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  44.8 
 
 		 234 aa  87.8  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  41.48 
 
 		 244 aa  87.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  44.72 
 
 		 225 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 228 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  48.82 
 
 		 231 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  44.63 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  49.54 
 
 		 228 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2363  MgtC/SapB transporter  43.61 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  40.71 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  45.81 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  49.56 
 
 		 232 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  40.94 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>