More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1919 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  52.21 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  52.11 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  48.11 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  43 
 
 		 221 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  42.79 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  40.29 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  42.45 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  42.04 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  41.59 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07790  MgtC/SapB transporter  45.73 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  40.99 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  40.09 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  41.94 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  38.86 
 
 		 248 aa  147  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  39.37 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  53.73 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  38.54 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  40.74 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  41.7 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  38.81 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  40.93 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  38.81 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  40.47 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  40.47 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  40.47 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  40.47 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  40.47 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  40.47 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  39.81 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  38.84 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  38.84 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  38.84 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  59.82 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2934  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  41.06 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  39.91 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  46.38 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  45.14 
 
 		 168 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  50 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  37.84 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  59.65 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  32.41 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  32.41 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  32.41 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  36.82 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  39.45 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  37.96 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  57.02 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  35.78 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  36.57 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  38.14 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1969  MgtC family membrane protein  53.28 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  48.12 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1877  putative magnesium transporter  53.28 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  34.88 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0407  MgtC family membrane protein  53.72 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  48.87 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  47.26 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  33.03 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  33.18 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  33.03 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  33.18 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  33.18 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  48.46 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  48.12 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  48.46 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  48.46 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  33.18 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  48.12 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  33.18 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  33.18 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  34.27 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  37.26 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  47.37 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.71 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  48.51 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  48.51 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  43.07 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  36.71 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  37.1 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  45.39 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  47.76 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  41.86 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  45.11 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  36.23 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5585  MgtC/SapB transporter  54.1 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  35.35 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  35.35 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  40.65 
 
 		 287 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  44.09 
 
 		 133 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  44.88 
 
 		 133 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  39.33 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5496  MgtC/SapB transporter  51.52 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6093  MgtC/SapB transporter  51.11 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  41.78 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  34.95 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1325  MgtC/SapB transporter  63.53 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  32.08 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>