298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1410 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  98.33 
 
 
240 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  86.67 
 
 
240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  58.82 
 
 
238 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  57.98 
 
 
238 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  57.98 
 
 
238 aa  274  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  58.33 
 
 
240 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  52.52 
 
 
238 aa  251  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  56.22 
 
 
234 aa  242  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  53.97 
 
 
245 aa  242  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  52.5 
 
 
240 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  52.38 
 
 
238 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  50.83 
 
 
240 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  53.19 
 
 
238 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  52.1 
 
 
238 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  52.08 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  54.2 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  52.63 
 
 
238 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  52.54 
 
 
240 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  52.21 
 
 
239 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  52.32 
 
 
242 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  52.52 
 
 
238 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  48.23 
 
 
236 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  47.03 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  48.46 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  52.68 
 
 
238 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  52.68 
 
 
238 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  42.04 
 
 
232 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  43.98 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  43.52 
 
 
238 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  40.72 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  40.27 
 
 
235 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  37.61 
 
 
230 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  37.39 
 
 
240 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  40.36 
 
 
237 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  40.36 
 
 
237 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  39.19 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  38.64 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  42.67 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  39.91 
 
 
237 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  36.77 
 
 
233 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  40.36 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  38.83 
 
 
225 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  38.83 
 
 
225 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  38.83 
 
 
225 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  38.77 
 
 
232 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  38.77 
 
 
232 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  35.87 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  38.77 
 
 
232 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  38.35 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  38.35 
 
 
225 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  37.29 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  37.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  37.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  37.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  34.8 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  37.77 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  37.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  37.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  37.07 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  37.77 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  37.07 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  37.07 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  35.87 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  34.38 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  35.43 
 
 
238 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  36.75 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  35.09 
 
 
238 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  35.09 
 
 
238 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  34.52 
 
 
204 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  45.8 
 
 
140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  35.64 
 
 
239 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  30.67 
 
 
225 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  32.59 
 
 
225 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  43.42 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  39.57 
 
 
141 aa  99  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  46.81 
 
 
174 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  32.44 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  36.02 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  36.87 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  31.56 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  32.59 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  32.59 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  32.59 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  30.26 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  32.14 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  45.86 
 
 
163 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  35.87 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  32.14 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  32.14 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  39.1 
 
 
231 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  41.61 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>