More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1988 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
162 aa  313  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  94.44 
 
 
162 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  57.59 
 
 
163 aa  191  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  58.11 
 
 
189 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  58.11 
 
 
189 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  55.41 
 
 
161 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  56.29 
 
 
194 aa  163  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  52.2 
 
 
172 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  52.2 
 
 
184 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  51.57 
 
 
172 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  54.48 
 
 
172 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  54.81 
 
 
189 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  52.05 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  60 
 
 
170 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  55.06 
 
 
176 aa  140  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  58.21 
 
 
205 aa  137  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1768  MgtC/SapB transporter  57.25 
 
 
152 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313608  normal  0.363956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5985  Mg(II) transport ATPase  56.03 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  56.45 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  45.45 
 
 
151 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  50.91 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  49.09 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36780  hypothetical protein  52.94 
 
 
163 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  48.6 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 
150 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3158  hypothetical protein  52.21 
 
 
163 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  47.11 
 
 
176 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  45.9 
 
 
133 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  44.26 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  43.26 
 
 
232 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  45.71 
 
 
225 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  43.2 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  45.71 
 
 
225 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  45.26 
 
 
225 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  45.26 
 
 
225 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  45.26 
 
 
225 aa  97.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  45.26 
 
 
225 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  38.99 
 
 
231 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.26 
 
 
227 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  43.44 
 
 
133 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  48.06 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  45 
 
 
225 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  39.72 
 
 
219 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.72 
 
 
219 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  45 
 
 
225 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  39.72 
 
 
219 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  40.27 
 
 
228 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  43.09 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  37.66 
 
 
240 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  45.65 
 
 
225 aa  94.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  44.29 
 
 
225 aa  94.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  42.76 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  44.29 
 
 
225 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  43.41 
 
 
167 aa  94  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  46.34 
 
 
228 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  47.01 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  40.8 
 
 
159 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  45.13 
 
 
230 aa  91.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  38.52 
 
 
226 aa  91.7  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  48.21 
 
 
227 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  43.75 
 
 
225 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  42.31 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
170 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  45.95 
 
 
242 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  37.01 
 
 
240 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  47.46 
 
 
238 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  42.96 
 
 
235 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  42.28 
 
 
232 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  42.28 
 
 
232 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
229 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  36.76 
 
 
221 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  38.73 
 
 
233 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  35.67 
 
 
166 aa  87.8  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  39.86 
 
 
221 aa  87.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  41.98 
 
 
182 aa  87.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  35.97 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  38.73 
 
 
232 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  36.84 
 
 
227 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  38.73 
 
 
233 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  39.42 
 
 
216 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  43.75 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  34.75 
 
 
215 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  46.04 
 
 
228 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  38.93 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170064 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  42.28 
 
 
232 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 
245 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  48.15 
 
 
237 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  35.76 
 
 
226 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 
238 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  48.15 
 
 
237 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  36.23 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  43.28 
 
 
237 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
248 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  49.53 
 
 
234 aa  84.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  35.76 
 
 
226 aa  84.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  35.76 
 
 
226 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  35.76 
 
 
226 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  39.02 
 
 
227 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>