297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2666 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  91.14 
 
 
237 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  91.14 
 
 
237 aa  430  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  91.98 
 
 
237 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  87.77 
 
 
234 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  87.77 
 
 
235 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  54.39 
 
 
232 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  51.91 
 
 
232 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  51.91 
 
 
232 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  51.91 
 
 
232 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  47.37 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  47.39 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  47.11 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  46.48 
 
 
225 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  46.48 
 
 
225 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  46.48 
 
 
225 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  47.11 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  47.11 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  46.55 
 
 
238 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  46.55 
 
 
238 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  46.55 
 
 
238 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  46.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  46.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  46.01 
 
 
225 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  46.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  46.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  46.55 
 
 
238 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  46.67 
 
 
235 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 
235 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 
235 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  46.01 
 
 
225 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 
235 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 
235 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 
235 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  46.22 
 
 
232 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  47.41 
 
 
240 aa  188  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  47.3 
 
 
234 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  41.41 
 
 
230 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  42.49 
 
 
238 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  42.06 
 
 
238 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  46.96 
 
 
235 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  47.01 
 
 
257 aa  169  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  47.26 
 
 
204 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  41.59 
 
 
238 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  41.15 
 
 
238 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  41.15 
 
 
238 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  41.1 
 
 
230 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  41.1 
 
 
230 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  40.83 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  40.44 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  44.25 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  37.05 
 
 
238 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  39.45 
 
 
238 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 
238 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  48.12 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  41.15 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  39.81 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  39.91 
 
 
240 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
239 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
236 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  41.82 
 
 
240 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  40.09 
 
 
239 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  38.3 
 
 
240 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  36.82 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  36.67 
 
 
240 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  38.67 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  40.83 
 
 
238 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  37.21 
 
 
238 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  43.26 
 
 
240 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  40.99 
 
 
240 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  42.55 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  50.63 
 
 
242 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  45.8 
 
 
140 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  49.38 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  37.27 
 
 
213 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  38.32 
 
 
229 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  39.42 
 
 
141 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  44.12 
 
 
219 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  44.12 
 
 
219 aa  101  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  44.12 
 
 
219 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  30.84 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  47.93 
 
 
225 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  37.14 
 
 
232 aa  99  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  39.71 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  38.42 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  38.97 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  49.51 
 
 
244 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  47.06 
 
 
189 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  47.06 
 
 
189 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  35.44 
 
 
210 aa  92  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  40.62 
 
 
287 aa  92  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  38.17 
 
 
165 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  41.3 
 
 
163 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  43.65 
 
 
133 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  38.37 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  46.67 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>