296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4580 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  97.02 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  97.02 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  97.02 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  97.02 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  95.32 
 
 
235 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  91.6 
 
 
238 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  91.6 
 
 
238 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  91.6 
 
 
238 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  91.6 
 
 
238 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  91.6 
 
 
238 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  91.18 
 
 
238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  91.18 
 
 
238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  90.76 
 
 
238 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  82.13 
 
 
235 aa  400  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  81.7 
 
 
235 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  46.98 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  46.98 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  46.22 
 
 
237 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  45.74 
 
 
237 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  45.74 
 
 
237 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  44.25 
 
 
240 aa  185  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  45.65 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  43.91 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  45.74 
 
 
237 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  43.23 
 
 
232 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  43.23 
 
 
232 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  43.23 
 
 
232 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  43.24 
 
 
233 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  43.24 
 
 
234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  41.59 
 
 
234 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  42.36 
 
 
230 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  43.89 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  38.75 
 
 
257 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  44.02 
 
 
225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  44.02 
 
 
225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  44.02 
 
 
225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  44.02 
 
 
225 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  43.54 
 
 
225 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  39.45 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  39.45 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  39.46 
 
 
238 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  42.35 
 
 
204 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  38.57 
 
 
234 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  41.2 
 
 
238 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  37.39 
 
 
230 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  36.96 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  37.71 
 
 
238 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  39.48 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
238 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  37.29 
 
 
238 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  37.29 
 
 
238 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  39.06 
 
 
238 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  38.12 
 
 
240 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  38.7 
 
 
236 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  37.44 
 
 
240 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  37.83 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  43.55 
 
 
240 aa  131  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  38.77 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  38.94 
 
 
238 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  37.77 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  37.34 
 
 
240 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  37.39 
 
 
240 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  49.68 
 
 
245 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 
238 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  37.61 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  37.18 
 
 
238 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  37.87 
 
 
240 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  34.12 
 
 
239 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  52.98 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  46.21 
 
 
140 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  38.72 
 
 
240 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  41.75 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  33.19 
 
 
213 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  38.66 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  40.32 
 
 
141 aa  92  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  30 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  30 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  30 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  35.14 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  35.14 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  35.14 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  35.14 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
212 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  42.11 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  42.97 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  38.77 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  38.77 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  39.06 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  35.71 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  42.5 
 
 
133 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  41.67 
 
 
133 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  40.19 
 
 
224 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  35.17 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  40.14 
 
 
287 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  40.5 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>