297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0848 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  90.83 
 
 		 240 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  85.42 
 
 		 240 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  67.23 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  65.42 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  68.78 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  66.25 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  62.08 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  61.97 
 
 		 239 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  60.53 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  58.82 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  58.33 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  56.67 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  56.83 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  54.17 
 
 		 238 aa  241  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  52.5 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  52.08 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  61.11 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  61.11 
 
 		 238 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  50.42 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  50.64 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  52.77 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  54.55 
 
 		 238 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  50.62 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  56.33 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  50 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  43.48 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  43.44 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  42.99 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  41.48 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  41.48 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  37.99 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  39.57 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  38.5 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  38.5 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  36.8 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  41.15 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  39.21 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  39.21 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  38.77 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  40.17 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  38.05 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  38.12 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  38.12 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  38.3 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  38.86 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  38.86 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  38.86 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  36.77 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  38.86 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  38.86 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  37.22 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  37.22 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  37.22 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  36.77 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  35.29 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  36.94 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  36.94 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  36.12 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  36.94 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  36.94 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  36.94 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  36.94 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  36.94 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  36.94 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  35.32 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  35.68 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  34.05 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  55.64 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  53.03 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  53.03 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  36.41 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  37.37 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  47.97 
 
 		 140 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  41.73 
 
 		 141 aa  101  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  31.78 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  48.51 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  31.6 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  31.6 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  32.47 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  32.47 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  32.47 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  31.03 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  30.6 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  42.61 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  31.03 
 
 		 225 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  40.41 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  29.74 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  47.15 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  47.5 
 
 		 172 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  45.97 
 
 		 161 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  31.6 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  48.33 
 
 		 172 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  39.46 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  48.33 
 
 		 184 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  37.72 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  37.72 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>