297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4157 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  99.11 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  99.11 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  63.44 
 
 
232 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  63.44 
 
 
232 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  63.44 
 
 
232 aa  268  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  61.23 
 
 
232 aa  265  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  46.7 
 
 
237 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  48.44 
 
 
234 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  47.77 
 
 
235 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  45.81 
 
 
237 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  45.81 
 
 
237 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  45.81 
 
 
237 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  47.06 
 
 
232 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  45.25 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  43.64 
 
 
240 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  41.41 
 
 
230 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  45.05 
 
 
238 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  43.89 
 
 
234 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  41.89 
 
 
235 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  44.59 
 
 
238 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  41.44 
 
 
235 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  42.73 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  43.11 
 
 
235 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  42.73 
 
 
238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  42.73 
 
 
238 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  42.73 
 
 
238 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  42.73 
 
 
238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  42.73 
 
 
238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  42.73 
 
 
238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  42.29 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  42.29 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  42.67 
 
 
235 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  42.67 
 
 
235 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  42.67 
 
 
235 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  42.67 
 
 
235 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  43.05 
 
 
235 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  43.05 
 
 
235 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  43.05 
 
 
235 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  40.45 
 
 
238 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  45.3 
 
 
238 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  40.36 
 
 
238 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  40.18 
 
 
238 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  40.18 
 
 
238 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  50.92 
 
 
238 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  39.73 
 
 
238 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  45.2 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  41.18 
 
 
257 aa  145  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  39.27 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  39.91 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  39.46 
 
 
239 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  38.81 
 
 
240 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  38.16 
 
 
240 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 
240 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  40.78 
 
 
245 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  39.73 
 
 
238 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  48.19 
 
 
240 aa  141  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  49.69 
 
 
234 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  40.97 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  42.64 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  41.82 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  39.82 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  40.18 
 
 
238 aa  138  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  39.73 
 
 
240 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  42.56 
 
 
204 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  42.23 
 
 
242 aa  134  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  52.82 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  45.08 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  39.55 
 
 
240 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  49.6 
 
 
140 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  32.84 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  45.52 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  46.36 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  46.38 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  49.21 
 
 
225 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  39.06 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  43.55 
 
 
141 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  46.38 
 
 
221 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  46.4 
 
 
225 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  46.4 
 
 
225 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  46.4 
 
 
225 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  46.4 
 
 
225 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  45.24 
 
 
225 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  45.6 
 
 
225 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  45.24 
 
 
225 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  45.45 
 
 
227 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  47.46 
 
 
221 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  44.17 
 
 
215 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  43.36 
 
 
245 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  39.87 
 
 
165 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  39.82 
 
 
238 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  39.82 
 
 
238 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  43.33 
 
 
210 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  44.97 
 
 
244 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  41.48 
 
 
219 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 
225 aa  101  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  41.48 
 
 
219 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>