299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1861 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  74.37 
 
 		 240 aa  334  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  68.49 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  65.13 
 
 		 238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  63.03 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  57.98 
 
 		 240 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  57.98 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  58.65 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  57.14 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  56.67 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  55.84 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  55.51 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  56.2 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  58.4 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  55.42 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  54.69 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  53.78 
 
 		 238 aa  231  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  53.81 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  53.78 
 
 		 238 aa  224  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  55.88 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  56.54 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  55.36 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  50.22 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  51.74 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  48.32 
 
 		 213 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  55.45 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  55.45 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  43.48 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  42.67 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  42.24 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  44.44 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  45.37 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  44.74 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  44.74 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  39.63 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  44.25 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  44.74 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  39.82 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  39.82 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  39.82 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  40.72 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  39.82 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  40.95 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  39.82 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  39.82 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  39.82 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  39.82 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  42.04 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  39.91 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  39.91 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  41.94 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  54.41 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  54.41 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  53.68 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  38.64 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  48.63 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  48.63 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  55.2 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  55.2 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  55.2 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  38.16 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  36.52 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  35.37 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  35.37 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  36.06 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  51.49 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  47.15 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  32.73 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  32.26 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  38.61 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  44.35 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.82 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  40.82 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  40.82 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  49.61 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  50.45 
 
 		 194 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  45.99 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  45.83 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  45.83 
 
 		 184 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  43.09 
 
 		 141 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  45 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  45 
 
 		 172 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  43.57 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 		 163 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  40.74 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  42.65 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  42.74 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  41.26 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  46.55 
 
 		 189 aa  92  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  40 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  40.31 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  40.8 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>