299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5334 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  74.37 
 
 		 238 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  73.11 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  66.81 
 
 		 238 aa  337  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  61.34 
 
 		 238 aa  290  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  58.33 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  58.75 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  56.71 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  57.92 
 
 		 240 aa  254  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  55.74 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  55.88 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  56.36 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  56.36 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  54.24 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  57.14 
 
 		 239 aa  225  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  52.5 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  56.33 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  54.35 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  54.15 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  55.02 
 
 		 240 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  52.7 
 
 		 238 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  52.74 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  53.22 
 
 		 240 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  50.44 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  46.61 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  55.8 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  55.8 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  43.23 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  42.79 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  43.36 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  43.84 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  43.64 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  43.64 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  43.38 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  41.82 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  40.44 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  36.68 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  38.36 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  38.36 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  38.36 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  38.36 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  38.36 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  38.36 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  38.36 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  38.36 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  39.73 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  39.91 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  41.44 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  43.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  39.91 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  39.91 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  37.45 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  40.53 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  36.96 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  37.28 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  39.81 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  39.81 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  39.81 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  56.67 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  56.3 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  37.67 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  35.29 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  34.39 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  39.5 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  37.39 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  36.8 
 
 		 257 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  47.97 
 
 		 140 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  33.82 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  40.09 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  49.19 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  49.19 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  36.57 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  47.27 
 
 		 194 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  37.24 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  42.65 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  35.06 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  42.65 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  40.13 
 
 		 174 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  42.31 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  41.91 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  40.14 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  49.02 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  48.08 
 
 		 184 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.14 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  48.08 
 
 		 172 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  40.14 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  37.7 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  40 
 
 		 141 aa  89.4  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  39.86 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  42.42 
 
 		 163 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  39.84 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  46.15 
 
 		 172 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  47.12 
 
 		 172 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>