298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1461 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  86.67 
 
 		 240 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  86.67 
 
 		 240 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  57.14 
 
 		 238 aa  279  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  57.56 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  57.14 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  57.92 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  55.93 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  52.94 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  54.31 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  55.3 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  50.42 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  52.77 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0651  MgtC/SapB transporter  53.78 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  51.04 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  50.42 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  48.98 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3514  MgtC/SapB transporter  56.05 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  53.94 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  50.86 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  52.12 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  50.87 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  51.75 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  49.77 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6569  MgtC/SapB transporter  47.3 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244488  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0820  MgtC/SapB transporter  50.43 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0861  MgtC/SapB transporter  50.43 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.0426117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  42.67 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  43.78 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  43.32 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  41.59 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  39.37 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  39.91 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  39.91 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  39.55 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  35.84 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  39.29 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  40.81 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  39.32 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  39.32 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  39.32 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  39.32 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  39.32 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  40.99 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  51.72 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  36.65 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  53.08 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  53.08 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  53.08 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  34.8 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  38.72 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  34.36 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  38.72 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  38.3 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  40.18 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  40.18 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  38.53 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  38.72 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  38.72 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  38.72 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  34.38 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  37.87 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  51.35 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  33.48 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  48.05 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  36.32 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  36.32 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  36.32 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  36.32 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  36.32 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  36.32 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  35.9 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  35.9 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  46.56 
 
 		 140 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  48.98 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0980  MgtC family protein  32.84 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  41.73 
 
 		 141 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  35.78 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  44.74 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  45.39 
 
 		 174 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  37.41 
 
 		 150 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  31.42 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  37.29 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 		 232 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  36.07 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  38.57 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  45.11 
 
 		 163 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  35.07 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  46.85 
 
 		 189 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  44.25 
 
 		 225 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  50 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  40 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  42.07 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  44.25 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  53.19 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  44.25 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  40.65 
 
 		 150 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  44.25 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  38.61 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>