More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0348 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  62.09 
 
 		 170 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  62.09 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  54.37 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  45.88 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  52.05 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  52.24 
 
 		 166 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  57.03 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  45.22 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  40.14 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  44.29 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  36.9 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  43.61 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  43.61 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  43.61 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  39.23 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  35.9 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  35.9 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  35.9 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  35.9 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 		 235 aa  99  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 		 228 aa  98.2  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  44.54 
 
 		 227 aa  98.2  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  42.65 
 
 		 225 aa  97.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  35.26 
 
 		 225 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  36.23 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  35.26 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  38.24 
 
 		 225 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 232 aa  95.5  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  35.26 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  42.74 
 
 		 225 aa  94.4  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  37.96 
 
 		 225 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  39.84 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  40.32 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  42.11 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.33 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  40.15 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  42.28 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  44.26 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  34.18 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  40.77 
 
 		 238 aa  91.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1981  sapB protein  38.33 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0451904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3348  sapB protein  38.33 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000020374  hitchhiker  0.00000000000000573517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2014  sapB protein  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.10796e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2063  sapB protein  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1836  sapB protein  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00191263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1810  peptide ABC transporter permease  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.95544e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1793  peptide ABC transporter permease  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000904933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2082  sapB protein  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1979  sapb protein  37.5 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.390566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  38.52 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  38.1 
 
 		 239 aa  89  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  40.46 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  38.46 
 
 		 223 aa  88.6  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  37.98 
 
 		 244 aa  88.2  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  40.16 
 
 		 235 aa  87.8  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  36.5 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  37.67 
 
 		 189 aa  87.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  36.5 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  37.2 
 
 		 233 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  36.5 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2363  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  36.5 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  36.5 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  35.33 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  36.5 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  34.01 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  36.5 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  36.44 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  36.5 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  37.1 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  40.94 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  36.44 
 
 		 225 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  39.55 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  37.58 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  39.31 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  38.62 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1842  MgtC/SapB transporter  35 
 
 		 226 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000347447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  36.88 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  37.31 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2398  MgtC/SapB transporter  41.6 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  34.75 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  36.59 
 
 		 233 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  38.62 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  42.98 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  36.05 
 
 		 233 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  31.62 
 
 		 237 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  39.84 
 
 		 232 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  32.45 
 
 		 240 aa  85.1  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  40.16 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  38.13 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1502  MgtC/SapB transporter  35.83 
 
 		 226 aa  84.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000187298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  38.03 
 
 		 150 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  37.93 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  36.36 
 
 		 225 aa  84.7  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  36.15 
 
 		 237 aa  84.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07790  MgtC/SapB transporter  39.67 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  36.54 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  43.36 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>