292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2236 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
159 aa  308  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  75.66 
 
 
166 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  68.87 
 
 
169 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  63.19 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  42.75 
 
 
151 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  43.14 
 
 
164 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  44.59 
 
 
158 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  47.93 
 
 
231 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  40.61 
 
 
245 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  47.01 
 
 
225 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  40.8 
 
 
150 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  45.86 
 
 
225 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  40 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2398  MgtC/SapB transporter  44.44 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5027  sapB protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0246703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4764  sapB protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  40.8 
 
 
162 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  44.17 
 
 
227 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5006  sapB protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5039  sapB protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000279435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0207  sapB protein  44.17 
 
 
226 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000857338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3506  MgtC/SapB transporter  44.17 
 
 
226 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  47.71 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  42.76 
 
 
227 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  41.21 
 
 
233 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  47.01 
 
 
235 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.41 
 
 
227 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  45.16 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  43.36 
 
 
232 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  41.21 
 
 
233 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  39.16 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  39.16 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  38.78 
 
 
225 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  39.16 
 
 
225 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  40.44 
 
 
229 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  45.87 
 
 
189 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0789  MgtC/SapB transporter  47.41 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  45.87 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  36.88 
 
 
225 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  39.16 
 
 
225 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  36.43 
 
 
215 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  41.1 
 
 
225 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 
173 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  39.16 
 
 
225 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  40.98 
 
 
178 aa  84.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4053  MgtC/SapB transporter  49.5 
 
 
173 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  40.74 
 
 
250 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  41.84 
 
 
228 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  37.14 
 
 
225 aa  84  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  37.14 
 
 
225 aa  84  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  41.8 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  45.95 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  39.31 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  37.93 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  35.62 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1376  MgtC/SapB transporter  48.21 
 
 
218 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1439  MgtC family membrane protein  45.19 
 
 
240 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.201234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  42.98 
 
 
234 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  42.24 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  39.58 
 
 
250 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  39.58 
 
 
250 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1271  MgtC/SapB transporter  35.77 
 
 
264 aa  80.5  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  40.98 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  48.96 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  36.65 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  41.96 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  37.31 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  45.95 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2147  MgtC/SapB transporter  39.44 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  44.64 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  43.75 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  39.42 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  39.42 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  41.86 
 
 
245 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0446  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.631605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  44.64 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  33.74 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  35.25 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  38.89 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  38.89 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  38.89 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  31.11 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  39.42 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  40.15 
 
 
234 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  43.64 
 
 
189 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  39.82 
 
 
224 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  43.12 
 
 
170 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  42.06 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  44.64 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  40.85 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  38.98 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0168  MgtC/SapB transporter  39.58 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0240664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  40.98 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>