291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6348 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6348  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 153 aa  297  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  43.87 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  40.46 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  40.62 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  45.87 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  42.96 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3306  MgtC/SapB transporter  49.6 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0259  hypothetical protein  43.51 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.448528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  43.26 
 
 		 189 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0591  MgtC/SapB transporter  51.2 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  38.76 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  39.53 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  39.53 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  40.88 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  38.93 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  40.31 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  37.16 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  43.36 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  46.74 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  45.71 
 
 		 194 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  41.07 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  38.14 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  35.51 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  42.31 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  40.74 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  41.44 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  40.59 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  38.14 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  40.2 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  34.85 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  39.17 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  36.17 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  39.81 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  36.8 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  44.57 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  37.59 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  38.46 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  39.81 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7258  putative MgtC family protein  39.86 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  35.82 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  39.81 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  41.35 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  41.35 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  44.55 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  40.78 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  35.82 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  42 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  34.33 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  43.75 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  39.05 
 
 		 244 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  30.88 
 
 		 244 aa  67.8  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  37.9 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  31.82 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  32.12 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  36.15 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  37.96 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  37.84 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  40.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  38.66 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  32.14 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  31.43 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  38.66 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0111  MgtC/SapB transporter  37.31 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  41.41 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  40.78 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  40.4 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  31.4 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4564  MgtC/SapB transporter  39.32 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  38.24 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  36.29 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  39.82 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1461  putative transporter transmembrane protein  38.46 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  37.86 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  35.59 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  34.27 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  37.86 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  37.1 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  36.03 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  38.61 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  41.94 
 
 		 239 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  38.61 
 
 		 234 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  38.83 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  34.07 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  33.65 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  38.54 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  36 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  38.6 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2436  MgtC/SapB transporter  38.94 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  39.81 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  39.18 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  39.09 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  39.09 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  31.82 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>