297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2508 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
147 aa  297  4e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  80 
 
 
145 aa  229  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  78.08 
 
 
143 aa  226  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3306  MgtC/SapB transporter  61.54 
 
 
157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  51.56 
 
 
158 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0591  MgtC/SapB transporter  51.77 
 
 
155 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0259  hypothetical protein  41.38 
 
 
185 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.448528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  34.11 
 
 
227 aa  87  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  37.96 
 
 
221 aa  86.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  42.34 
 
 
212 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
224 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  41.94 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  42.86 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  38.28 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  38.28 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  38.28 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  38.28 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  38.28 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  38.28 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  38.28 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  37.5 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  33.33 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  38.58 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  39.52 
 
 
172 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  39.52 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  33.99 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  34.35 
 
 
228 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  36.07 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  36.22 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  35.82 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  36.22 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  36.22 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  40.34 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  40.77 
 
 
245 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  40.19 
 
 
240 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  35 
 
 
227 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  37.9 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6348  MgtC/SapB transporter  40.46 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278806  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  35.29 
 
 
234 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  39.25 
 
 
240 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  35.07 
 
 
244 aa  76.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  37.6 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  36.89 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  38.26 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  35.07 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  31.97 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  37.96 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  36.59 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  36.89 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  34.31 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  32.54 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  33.33 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0206  MgtC/SapB transporter  40.37 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  33.58 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  33.58 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  35.34 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  34.19 
 
 
235 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  34.19 
 
 
235 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  36.44 
 
 
218 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  38.71 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  34.19 
 
 
235 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  36.84 
 
 
240 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
237 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  32.65 
 
 
231 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  34.19 
 
 
235 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  34.29 
 
 
235 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  34.29 
 
 
235 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  37.14 
 
 
235 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  33.58 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  36.11 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  35.71 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0406  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.452939  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6387  predicted protein  35.38 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0649963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  37.6 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  34.81 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  39.62 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  35.29 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  33.61 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  33.33 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  35.29 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  36.84 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  33.57 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  37.1 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  38.38 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  35.29 
 
 
225 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  35.19 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  36.8 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  37.38 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  35.04 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  33.83 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  32.37 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  34.29 
 
 
238 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  35.11 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>