281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0259 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.448528 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  41.38 
 
 		 147 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  46.56 
 
 		 145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  42.25 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  43.07 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3306  MgtC/SapB transporter  41.96 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0591  MgtC/SapB transporter  43.28 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  35.37 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  31.58 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  38.33 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00139  Mg(2+) transport ATPase protein C  31.3 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6348  MgtC/SapB transporter  43.51 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  39.32 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  35.86 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  34.35 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  32.21 
 
 		 244 aa  67.8  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  34.78 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  35.14 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  34.78 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  28.78 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  35.54 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  31.29 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  38.54 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002230  membrane protein  27.48 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  38.54 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  28.47 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  32.81 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2170  putative MgtC/SapB transporter  28.68 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  33.82 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  28.17 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  35.65 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  28.57 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  33.1 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  29.25 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  35.43 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  31.51 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  29.58 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  31.51 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  38.68 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  35.85 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  34.48 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.92 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  31.15 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  31.09 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  32.84 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  27.78 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  30.16 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  35.42 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  35.42 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  35.42 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  35.42 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  35.42 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1229  MgtC/SapB transporter  32.2 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  43.75 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  30.51 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  35.88 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  35.51 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  35.43 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  36.15 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  32.23 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  34.23 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  33.66 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  32.76 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  31.93 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  33.62 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  34.62 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  34.95 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  33.62 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  34.62 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  34.62 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  40.37 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  29.41 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  36.67 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  29.41 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  34.95 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  29.41 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  29.41 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  31.4 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  29.41 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  29.41 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  34.15 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  39.39 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  42.42 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  42.42 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  42.42 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  31.82 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  42.42 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  31.48 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  42.42 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  36.19 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  42.42 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00280  transporter, MgtC/SapB family  36.36 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  42.42 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  30.16 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  35.29 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.530207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>