295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2170 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2170  putative MgtC/SapB transporter  100 
 
 
168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002230  membrane protein  75.48 
 
 
165 aa  244  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00139  Mg(2+) transport ATPase protein C  73.72 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1229  MgtC/SapB transporter  49.33 
 
 
159 aa  153  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3628  MgtC/SapB transporter  47.13 
 
 
160 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  40.48 
 
 
141 aa  87.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  33.83 
 
 
140 aa  87.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  32.59 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  39.01 
 
 
215 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  38.19 
 
 
219 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  38.19 
 
 
219 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  39.01 
 
 
215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  39.01 
 
 
215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  39.01 
 
 
215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.01 
 
 
215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  37.6 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  36.81 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  40.5 
 
 
221 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  36.72 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  37.3 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  32.65 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  39.83 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  34.25 
 
 
215 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  34.69 
 
 
228 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  34.01 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  38.1 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  30.5 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  41.23 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.87 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  40.87 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  40.87 
 
 
219 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  36.72 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
238 aa  77.4  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  34.29 
 
 
227 aa  77.4  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  35.53 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  39.84 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  36.13 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  32.52 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  32.33 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  34.71 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  38.18 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  31.51 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1842  MgtC/SapB transporter  35.81 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000347447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  33.83 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  32.33 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  39.05 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  32.06 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  37.29 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  37.29 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  32.37 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  32.37 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  32.37 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  32.37 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  38.83 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  32.37 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  36.64 
 
 
238 aa  74.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  39.45 
 
 
232 aa  74.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  38.74 
 
 
240 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0206  MgtC/SapB transporter  37.4 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1502  MgtC/SapB transporter  35.53 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000187298  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  35.29 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  31.43 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  34.95 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1271  MgtC/SapB transporter  38.18 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  42.39 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  30.71 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  30 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  35.29 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  34.69 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  32.54 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  33.09 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  34.48 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  37.31 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  37.84 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  34.29 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  35.25 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  35.85 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  35 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  39.47 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  44.9 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  35.85 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  39.33 
 
 
244 aa  72  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  39.25 
 
 
223 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  29.25 
 
 
235 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0446  MgtC/SapB transporter  32.61 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.631605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  34.31 
 
 
225 aa  72  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  29.34 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  34.29 
 
 
235 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  38.74 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  33.9 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  35.85 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  28.93 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5334  MgtC/SapB family transporter  38.83 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000795901  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  35.83 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  34.62 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  27.81 
 
 
244 aa  70.9  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>