295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3628 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3628  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 160 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1229  MgtC/SapB transporter  68.99 
 
 		 159 aa  230  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2170  putative MgtC/SapB transporter  47.13 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00139  Mg(2+) transport ATPase protein C  41.94 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002230  membrane protein  42.86 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  39.33 
 
 		 219 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  39.33 
 
 		 219 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  39.33 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.33 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  46.79 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  39.33 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  39.33 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4858  MgtC/SapB transporter  38.14 
 
 		 218 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  39.33 
 
 		 215 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  38.13 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  38.13 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  38.13 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  38.13 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  42.34 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  40 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  37.19 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  36.69 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  36.69 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  37.41 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  45.92 
 
 		 219 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  45.92 
 
 		 219 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  45.92 
 
 		 219 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  46.32 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  43.09 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  42.28 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.56 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  50 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  46.94 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  35.97 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  35.97 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  47.42 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  42.28 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  37.8 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  36.97 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  35.96 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  41.44 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  45.83 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  44.04 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  40.46 
 
 		 219 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  41 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  35.04 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  40.4 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  34.31 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  34.48 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  35.04 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  35.04 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  37.01 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  35.04 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  34.31 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  35.04 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  35.97 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  41.88 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  34.56 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  35.04 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  46.32 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  36.42 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  38.17 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  38.17 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  36.62 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  45.98 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  36 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  36.8 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  44.21 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  36.07 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  43.88 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0446  MgtC/SapB transporter  42.72 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.631605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  43.22 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  40.2 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  42.71 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  39.64 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  44.44 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  43.68 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  40.59 
 
 		 228 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  44.44 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  33.58 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  39.56 
 
 		 235 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  45.05 
 
 		 232 aa  73.9  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  40.21 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  33.58 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  33.58 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  37.9 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  33.58 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  34.23 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  33.58 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  42.55 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  45.05 
 
 		 232 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  47.62 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  47.62 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  33.58 
 
 		 238 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  47.62 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>