295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00139 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00139  Mg(2+) transport ATPase protein C  100 
 
 
165 aa  332  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002230  membrane protein  88.48 
 
 
165 aa  300  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2170  putative MgtC/SapB transporter  73.72 
 
 
168 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1229  MgtC/SapB transporter  42.48 
 
 
159 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3628  MgtC/SapB transporter  41.94 
 
 
160 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  36.91 
 
 
227 aa  91.3  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  38.13 
 
 
228 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  37.04 
 
 
227 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  38.14 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  34.51 
 
 
215 aa  84.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
218 aa  84.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  35.61 
 
 
168 aa  84.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  41.32 
 
 
150 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  41.94 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  41.94 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  41.94 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  41.94 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  35.77 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  41.94 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  41.94 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  41.94 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  40.37 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  35.59 
 
 
225 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  33.1 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.42 
 
 
233 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  35.59 
 
 
225 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  35.29 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  34.59 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  35.59 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  35.59 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  35.59 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  36.24 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  36.84 
 
 
227 aa  81.3  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  37.59 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  34.93 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  40.32 
 
 
215 aa  80.9  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  37.12 
 
 
225 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  36.09 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  38.33 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  33.79 
 
 
238 aa  80.5  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  36.57 
 
 
235 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  33.59 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  35.29 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  41.67 
 
 
225 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
235 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.83 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  40.83 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  40.83 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
235 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
235 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  35.61 
 
 
232 aa  79  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  40.83 
 
 
225 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  41.74 
 
 
189 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  39.52 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  38.1 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  43.62 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  40 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  35.29 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  33.1 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  33.78 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  40 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  40 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  40 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  33.08 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
226 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  38.84 
 
 
221 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  36.97 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  36.97 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  41.67 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  34.31 
 
 
235 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  38.66 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  34.71 
 
 
233 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  32.41 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  37.82 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  42.42 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  37.14 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  34.65 
 
 
238 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  36.97 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  37.93 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  34.75 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  38.4 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  38.74 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  35.16 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  34.56 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  34.75 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  34.75 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  33.33 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  40.87 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  34.75 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  34.75 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  36.51 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  34.75 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  34.75 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  34.69 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  38.66 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  34.75 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  40 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  34.38 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.295436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>