293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3306 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3306  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  61.54 
 
 		 147 aa  189  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  60.99 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  59.44 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  50.38 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0591  MgtC/SapB transporter  46.88 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0259  hypothetical protein  41.96 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.448528 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6348  MgtC/SapB transporter  49.6 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  37.69 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  35.33 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  34.38 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  36.3 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  41.82 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  37.69 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  35 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  36.64 
 
 		 189 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  35 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  40.91 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  30.82 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  35.37 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  43.22 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  34.07 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  34.07 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  34.07 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  33.1 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  33.1 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  33.1 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  31.85 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  35.04 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  38.14 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  33.1 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  35.43 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  37.12 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  33.56 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  35.77 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  36.22 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  33.33 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  35.04 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  37.1 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  36.03 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  32.28 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  38.14 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  33.79 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  37.12 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  32.37 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  36.7 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  35.04 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  32.41 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  33.91 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  37.62 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  36.59 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  34.31 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  37.63 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  37.8 
 
 		 194 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  32.69 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6538  MgtC/SapB transporter  40.17 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  38.93 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 172 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 233 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  39.09 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  33.58 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0206  MgtC/SapB transporter  35.58 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  30 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  37.86 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  35.34 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  46.67 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  34.96 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  38 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  34.78 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  38.24 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  35.19 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  37.29 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  39.8 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  30.22 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  38.1 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  39.8 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  28.97 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6253  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.927456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  33.82 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  37.17 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  32.56 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6185  MgtC/SapB transporter  38.94 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  33.64 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  33.64 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  33.64 
 
 		 226 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  37.38 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>