289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6538 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6538  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6253  MgtC/SapB transporter  98.31 
 
 		 236 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160487  normal  0.927456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6185  MgtC/SapB transporter  81.55 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5535  MgtC/SapB transporter  68.64 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.311491  normal  0.0977007 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6582  MgtC/SapB transporter  83.22 
 
 		 159 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2147  MgtC/SapB transporter  53.46 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0456  MgtC/SapB transporter  51.25 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0657  MgtC/SapB transporter  41.46 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  40.71 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  34.01 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  35.19 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  38.67 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  41.61 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  41.48 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  35.29 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  43.8 
 
 		 133 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  43.8 
 
 		 133 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  43.8 
 
 		 133 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  32.71 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  30.04 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  40.48 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  27.43 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  37.41 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  37.41 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  37.41 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  40.48 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  25.35 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  36.3 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  36.05 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  39.74 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  35.21 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1140  hypothetical protein  30.43 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000347629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  46.85 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  37.11 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  35.29 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  37.06 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  40.29 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  36.11 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  36.84 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  37.9 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  42.45 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  39.86 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  31.05 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  35.86 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  35.86 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  35.86 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  35.86 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  35.86 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  43.12 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  34.44 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  35.86 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  35.86 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  36.11 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  32.16 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  29.36 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  35 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  28.97 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  35.1 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  25.93 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  35.25 
 
 		 173 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  39.04 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  35.4 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  36.49 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  40.54 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  37.69 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1271  MgtC/SapB transporter  27.6 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  38.98 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  38.98 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1376  MgtC/SapB transporter  39.04 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  38.98 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  38.98 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  38.98 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  38.98 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  37.96 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  32.64 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  40 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  36 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  41.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  35.71 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8016  MgtC/SapB transporter  37.6 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  38.36 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1926  MgtC/SapB transporter  30.3 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  35.71 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  34.53 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  37.67 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  36.11 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3506  MgtC/SapB transporter  29.94 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  36.11 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  36.11 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  37.93 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.568425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>