299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7258 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7258  putative MgtC family protein  100 
 
 
167 aa  320  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 
150 aa  97.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  40.97 
 
 
235 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  39.58 
 
 
234 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  42.76 
 
 
237 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  42.76 
 
 
237 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  44.12 
 
 
141 aa  94.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
238 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
238 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
238 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  46.72 
 
 
189 aa  94  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2677  protein MgtC  39.86 
 
 
230 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0157204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  45.26 
 
 
189 aa  90.5  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  39.69 
 
 
230 aa  90.5  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31460  putative transport protein  39.16 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000370245  hitchhiker  0.00000000416187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  38.89 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  42.64 
 
 
233 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2287  MgtC/SapB transporter  40.98 
 
 
158 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  45.08 
 
 
238 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  43.33 
 
 
232 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  56.18 
 
 
205 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  46.96 
 
 
240 aa  88.2  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  43.51 
 
 
237 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2508  MgtC/SapB transporter  37.78 
 
 
147 aa  87.8  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0205  MgtC/SapB transporter  38.98 
 
 
143 aa  87.8  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0249052  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2648  MgtC/SapB transporter  42.07 
 
 
237 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.496907 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  42.86 
 
 
133 aa  87.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 
235 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 
235 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 
235 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  42.86 
 
 
133 aa  87  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  45.24 
 
 
189 aa  87.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  43.41 
 
 
238 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  39.61 
 
 
245 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  45.45 
 
 
235 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  42.28 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  50.96 
 
 
240 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 
235 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 
235 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  41.9 
 
 
212 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  45.16 
 
 
238 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  38.85 
 
 
234 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  47.79 
 
 
239 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1142  MgtC/SapB transporter  39.17 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.143117  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  47.24 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  45.45 
 
 
235 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11841  Mg2+ transport P-type ATPase C mgtC  43.7 
 
 
234 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  50.98 
 
 
240 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  44.53 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  44.53 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  42.02 
 
 
215 aa  85.5  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  44.83 
 
 
235 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  47.37 
 
 
238 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  40.52 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  44.26 
 
 
238 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  40.16 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  44.8 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 
240 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  40.62 
 
 
225 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  40.94 
 
 
227 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  49.5 
 
 
238 aa  84.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  41.73 
 
 
221 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  41.89 
 
 
172 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  52.53 
 
 
238 aa  84.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  44.83 
 
 
232 aa  84  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  45.63 
 
 
238 aa  84  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  41.79 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  48.04 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  39.37 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  46.56 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  46.96 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  46.53 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2196  MgtC/SapB transporter  41.22 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  44.66 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  40.74 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4157  hypothetical protein  43.14 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.926737  normal  0.782611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3989  protein MgtC  43.14 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3971  protein MgtC  43.14 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  39.19 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4043  Mg(2+) transport ATPase protein C  43.14 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.085999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4094  hypothetical protein  43.14 
 
 
225 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  40.71 
 
 
219 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1996  MgtC/SapB transporter  42.64 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03442  normal  0.0396859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  40.71 
 
 
219 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  38.1 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  40.71 
 
 
219 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1228  MgtC/SapB transporter  45.76 
 
 
238 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  41.6 
 
 
238 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  40.27 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  40.74 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  40.74 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>