250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2196 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2196  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
244 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0593  MgtC/SapB transporter  50.34 
 
 
174 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7258  putative MgtC family protein  41.22 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1858  Mg2+ transporter  40.34 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  34.95 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4342  MgtC/SapB transporter  33.56 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4802  MgtC/SapB transporter  36.96 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167342  hitchhiker  0.000205656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  37.3 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4111  MgtC/SapB transporter  32.89 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4187  MgtC/SapB transporter  32.89 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  34.04 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  34.04 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  34.04 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  34.04 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  32.24 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1509  MgtC family protein  37.82 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0099302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  32.24 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1344  MgtC family protein  37.82 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.945606  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0963  MgtC family protein  37.82 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0328  MgtC family protein  37.82 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3972  MgtC/SapB transporter  36.29 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712404  normal  0.0780346 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0606  MgtC family protein  37.82 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1224  putative magnesium transporter  37.82 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1053  MgtC/SapB transporter  36.29 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000026259  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5577  MgtC/SapB transporter  36.29 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000861867  hitchhiker  0.00823603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3644  MgtC/SapB transporter  36.29 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00528341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  37.78 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4115  MgtC/SapB transporter  36.97 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140688  normal  0.0238534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4723  MgtC/SapB transporter  36.29 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000431441  hitchhiker  0.00163781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4580  MgtC/SapB transporter  36.97 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000052429  hitchhiker  0.00000214874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2486  MgtC family protein  37.82 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1296  putative magnesium transporter  37.82 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  34.75 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  37.1 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  33.33 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  37.4 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  37.04 
 
 
133 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  40.46 
 
 
158 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  36.3 
 
 
133 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  34.09 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  34.09 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  34.09 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  30.99 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  32.56 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  34.62 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  33.33 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  33.07 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  34.15 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  34.33 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  33.85 
 
 
159 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  35 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61330  magnesium transporter, MgtC family  38.84 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.568425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  30.54 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  33.6 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  37.63 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  36.7 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  37.82 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5281  hypothetical protein  39.09 
 
 
235 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  36.43 
 
 
172 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  35.43 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1591  MgtC/SapB transporter  38.89 
 
 
238 aa  58.9  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  36.09 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  36.43 
 
 
184 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  38.93 
 
 
174 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  35.71 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3244  magnesium transporter MgtC family protein  30.13 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  36.72 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2517  MgtC/SapB transporter  30.13 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.769904  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  33.56 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  38.46 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0740  Mg2+ transporter  30.34 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0377433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  33.58 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  33.58 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  36.22 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  36.61 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  40.5 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  32.59 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  33.83 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  40.38 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  29.71 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  37.5 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  33.09 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  28.96 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  31.78 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  36.36 
 
 
172 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2666  MgtC/SapB transporter  34.71 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  33.33 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  38.46 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  33.33 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  34.88 
 
 
189 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0446  MgtC/SapB transporter  33.62 
 
 
158 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.631605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  35.34 
 
 
150 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  37.04 
 
 
163 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  34.62 
 
 
239 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0406  MgtC/SapB transporter  33.65 
 
 
249 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.452939  normal  0.474699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>