36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1736 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  36.82 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  32.61 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  34.09 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  34.4 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  35.75 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  31.34 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  31.95 
 
 		 164 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  33.72 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  34.38 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  30.35 
 
 		 171 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  32.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  26.36 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  26.57 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  28.23 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  21.36 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  23.41 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.93 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  24.35 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  24.52 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  29.13 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  33.91 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.49 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  33.04 
 
 		 238 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>