29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5725 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  62.5 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  48.28 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  41.04 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  38.53 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  39.29 
 
 		 191 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 194 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  38.38 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  39.74 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  36.27 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  35.53 
 
 		 199 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  32.23 
 
 		 205 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  38.51 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  35.45 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  32.63 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  32.28 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  34.09 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  28.28 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  30.43 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  32.58 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  27.34 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.42 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.32 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  25.93 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>