28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00435 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  53.59 
 
 		 199 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  44.66 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  40.98 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  37.44 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  33.19 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  33.49 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  35.41 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  34.22 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  33.17 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  32.23 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  33.01 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  28.78 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  31.76 
 
 		 164 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  28.66 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.17 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  27.88 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  26.92 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  23.35 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  25.68 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  26.99 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  21.02 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  25.48 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  28.98 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  23.27 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>