29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2475 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 194 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  45.22 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  41.98 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  39.38 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 		 198 aa  144  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  41.45 
 
 		 176 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  41.33 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  33.49 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  38.93 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  37.41 
 
 		 164 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  30.49 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  29.7 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  34.75 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  30.41 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  31.97 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  28.28 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  30 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.14 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  27.86 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  35.09 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  25.87 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  22.96 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>