30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4689 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  42.65 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  36.46 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  31.34 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  29.7 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  34.34 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  28.94 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  35.14 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 212 aa  87.8  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  34.53 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  35.11 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  33.79 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  30.53 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  27.03 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  33.86 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  27.92 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  28.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  25.39 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  28.79 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.95 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  27.5 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>