31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5417 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  41.4 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  42.72 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  36.68 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  40.98 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  42.71 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  39.38 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  39.47 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  39.29 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  37.56 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  37.56 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  35.23 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  37.34 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  37.82 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  30.93 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  35.52 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  34.34 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  35.56 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  30.56 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  32.41 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  30.15 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  25.85 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  30.14 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  27.05 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  24.51 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  28.37 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  26.15 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.38 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  27.86 
 
 		 247 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>